Zu den wichtigsten Umweltwirkungen in der Schweinehaltung gehören THG-Emissionen sowie N- und P-Nährstoffausscheidungen, die zur Eutrophierung und Versauerung von Böden und Gewässern führen. Die Verifikation alternativer Methoden zur Erfassung von Effizienzmerkmalen für eine effiziente züchterische Verbesserung der Nährstoffeffizienz ist das übergeordnete Ziel des Projektes PigBreedE. Dieses Ziel soll innerhalb von in vier Teilprojekten (TP) erreicht werden. In den TPs werden zum Teil Gewebe-/Kotproben, Daten und Ergebnisse aus vorangegangenen Projekten integriert.
Das TP1 zielt auf die Weiterentwicklung und Überprüfung der hologenomischen Selektion für Effizienzmerkmale (NUE) bis hin zur Praxisreife. In diesem TP werden Zuchtplanungsrechnungen durchgeführt, um zu evaluieren, wie sich die neunen Effizienzmerkmale unter Berücksichtigung der Mikrobiominformationen in ein Schweinezuchtprogramm integrieren lassen.
In TP2 werden mit Hilfe der Shotgun-Sequenzierung und Metabolomik-Techniken Proben aus dem ProtiPig-Projekt und aus TP3 sequenziert. Mit den resultierenden Sequenzdaten sollen die mikrobiellen Gemeinschaften, ihre Funktionalität und Metaboliten tiefergehend analysiert werden.
Im TP3 sollen die in diesen Projekten angewandten Methoden und gewonnenen Erkenntnisse mit Hilfe von Zuchttieren einer Reinzuchtlinie des Schweinezuchtunternehmens BHZP überprüft werden. Hierzu sollen neben der Futteraufnahme, Blut- und Kotproben bei 500 Landrasseeber gesammelt und der BUN sowie die Mikrobiotazusammensetzung analysiert werden.
Im TP4 sollen diese Überlegungen aus TP1 auf eine Optimierung der N-Nutzungseffizienz auch auf die Ergebnisse von TP3 erweitert werden. Darüber hinaus ist ein weiteres Ziel eine Datengrundlage für weitere Auswertungen zu schaffen und der Wissenstransfer. Die Erkenntnisse des Projektes werden in Workshops und Pressemitteilungen der Öffentlichkeit präsentiert.